随着辛亥革命推翻封建帝制，孙中山就任临时大总统，卢慕贞也得以前往南京与孙中山团聚，但一个多月后卢慕贞便返回广东，此后在翠亨与澳门两地居住。
▲珠海外沙村牌坊。
徐存福告诉记者，在南京的日子裹，卢慕贞悉心照顾孙中山的生活，从不抛头露面。“面对中外贵宾如云似海的各种政治场合，对自幼缠足梳髻的卢慕贞来说，与其说是一种无上尊荣，倒不如说是一种精神上的累赘，她很想摆脱它，重温那种平静、淡泊、与世无争的自我生活。”徐存福说。
早在1921年6月底，袁世凯当局准予孙科、孙蜒官费赴美留学，孙蜒后就读于美国加州柏克莱大学，成绩优异。1913年3月，年仅20岁的孙蜒因患肾疾，久医不愈，遂回澳门其母卢慕贞处治疗。孙蜒到澳门后，病情未见好转。当年6月25日，孙蜒告别人世。
卢慕贞失去长女的巨大悲痛尚未完全消除，紧接着孙中山便向她提出离婚的请求，对她而言又是一次前所未有的无情打击。1915年3月，孙中山给卢慕贞写信说明此事，派他的侍卫长邓卓如和儿子孙科将信送达卢慕贞的手中。贤淑而又深明大义的卢慕贞平静询问了宋庆龄一些情况后，同意离婚，并用毛笔在信上写了一个“可”字，然后对侍卫长说：“阿卓！我学识浅薄，不谙政治，实在帮不了先生的忙，有宋女士当贤内助，我就放心了！”并要他转告宋庆龄，愿与她姊妹相称，随即办了离婚协议，结束了同孙中山31年的婚姻。同年10月25日，孙中山与宋庆龄在日本东京结婚，卢慕贞还去信祝贺。
