公元1644年，闯王李自成率领农民起义军攻入大明王朝的都城北京城，崇祯皇帝吊死在煤山上。最后也是清军占领了北京城。崇祯皇帝死后，很多不愿投降清军的明朝的遗老遗少都逃向了南方，拥立福王为新皇帝，定年号弘光，明代的文武百官也是想固守南方抵抗清军的南下，稳固南明朝廷的地位。

但是定都南京的南明朝廷也是没有留多少年，很快清军南下，先是围攻扬州，扬州很快沦陷，发生了“扬州十日”的屠杀，之后清军趁胜追击，继而攻破南京，打击南明的抵抗信心。

南京陷落，刚刚登基不久的南明弘光皇帝也被清军俘虏，沦为阶下囚。后来南明遗民因为没有一个强有力的君主统治，陷入到了一个群龙无首的境地，除了北方清军的威胁之外，自己方面也是十分混乱。

1645年，明唐王在军队首领的拥护下，改年号为隆武，隆武皇帝在位时，南明朝廷积极开展北伐，但是南明的实力更是江河日下。再加上后来的吴三桂反叛，南明朝终于结束了自己短暂的历史。

随着南明的灭亡，在广州一带的遗留明军不愿投降清军，在一位名叫张杰绪的带领下，部队一共几百来号人，再加上愿意随行的民众，一共300多明军踏上了南下寻找安宁家园的路。

这300多位明军最后看上了一个名为纳土纳群岛的地方，这个群岛在当初他们这一行人到的时候是没有名字的，今天在地图上看到的“纳土纳”这个名字其实是之后荷兰人占领时才有的名字。

该群岛位南海中心位置，该群岛共有272个岛屿组成，最大的岛名叫纳土纳岛，要通过马六甲海峡此群岛是必须经过的地方。当时的这300多人来到这里还是一片荒芜，是他们完成了该岛最初的环境改造。而那个张杰绪实际上成为了这个小社会的首领，也建立了一个王国，只不过没有名字，姑且叫做“张氏王国”吧。

之后张杰绪去世，由于王国内部的政治斗争和外部荷兰殖民者的进犯，这个“张氏王国”灭亡了，由荷兰人统治。荷兰人的统治持续了340年，之后于1942年由日本占领。最后结果都清楚，二战日本所属的轴心国战败，纳土纳群岛摆脱日本统治，归到印尼的版图内，可是这时荷兰人趁机想占领纳土纳群岛继续统治。

印尼当然不会愿意自己辛辛苦苦回归的领土又重新落入别人的手里。印尼人奋起反抗，最后通过三次比较大的战役打败了荷兰殖民者，纳吐纳群岛主权正式移交印尼。

因为该群岛地理位置十分重要，在国际航道马六甲海峡的必经之路上；经济方面，该群岛蕴含丰富的石油和天然气资源，天然气存储量约占世界的60%，如今这地方可谓富得流油。这个群岛由于种种方面的因素这几年再次受到世界的关注。